Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB11E5RHQ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB11E5RHQ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB11E5RHQ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms