Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4DLN1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4DLN1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4DLN1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4DLN1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4DLN1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
B4DLN1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4DLN1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4DLN1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4DLN1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4DLN1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4DLN1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
B4DLN1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4DLN1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4DLN1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4DLN1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4DLN1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4DLN1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
B4DLN1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4DLN1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4DLN1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4DLN1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4DLN1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
B4DLN1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4DLN1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4DLN1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4DLN1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4DLN1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4DLN1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4DLN1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4DLN1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4DLN1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4DLN1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4DLN1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4DLN1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
B4DLN1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4DLN1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4DLN1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4DLN1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4DLN1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4DLN1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4DLN1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4DLN1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4DLN1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4DLN1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4DLN1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4DLN1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4DLN1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4DLN1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4DLN1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4DLN1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4DLN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4DLN1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4DLN1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4DLN1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
B4DLN1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
B4DLN1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
B4DLN1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4DLN1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4DLN1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4DLN1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4DLN1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4DLN1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4DLN1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4DLN1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4DLN1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
B4DLN1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4DLN1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4DLN1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4DLN1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4DLN1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4DLN1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
B4DLN1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
B4DLN1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
B4DLN1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
B4DLN1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4DLN1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4DLN1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4DLN1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4DLN1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4DLN1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4DLN1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4DLN1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4DLN1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4DLN1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
B4DLN1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4DLN1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4DLN1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4DLN1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4DLN1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4DLN1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4DLN1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms