Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DEV8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DEV8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DEV8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DEV8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DEV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DEV8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B4DEV8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DEV8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DEV8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DEV8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DEV8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DEV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
B4DEV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
B4DEV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DEV8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DEV8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DEV8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DEV8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DEV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DEV8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DEV8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DEV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DEV8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DEV8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DEV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DEV8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DEV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DEV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DEV8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DEV8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DEV8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DEV8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DEV8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DEV8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DEV8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DEV8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DEV8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DEV8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DEV8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DEV8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DEV8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DEV8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DEV8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DEV8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DEV8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DEV8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DEV8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DEV8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DEV8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DEV8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DEV8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DEV8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DEV8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DEV8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DEV8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DEV8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DEV8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
B4DEV8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
B4DEV8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
B4DEV8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
B4DEV8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
B4DEV8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
B4DEV8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
B4DEV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
B4DEV8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
B4DEV8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
B4DEV8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
B4DEV8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
B4DEV8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
B4DEV8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
B4DEV8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
B4DEV8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms