Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01549A6NIU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01549A6NIU2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms