Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC160A6NGH7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC160A6NGH7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC160A6NGH7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC160A6NGH7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms