Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A6NDN8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A6NDN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NDN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NDN8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NDN8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NDN8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NDN8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NDN8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NDN8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NDN8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NDN8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NDN8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NDN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NDN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NDN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NDN8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NDN8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A6NDN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NDN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NDN8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NDN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NDN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NDN8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NDN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NDN8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NDN8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NDN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NDN8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NDN8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NDN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NDN8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NDN8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NDN8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NDN8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NDN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NDN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NDN8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NDN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NDN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NDN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NDN8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NDN8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NDN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NDN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NDN8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NDN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NDN8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NDN8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NDN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NDN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NDN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NDN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NDN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NDN8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NDN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NDN8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NDN8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NDN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NDN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NDN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NDN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NDN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NDN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NDN8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NDN8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NDN8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NDN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NDN8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NDN8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NDN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NDN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NDN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NDN8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NDN8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NDN8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms