Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ72

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ72 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PQ72 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ72 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ72 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ72 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms