Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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