Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF527-202ENST00000436120 2828 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRAMEF12-201ENST00000357726 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SERPINA12-201ENST00000341228 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF438-206ENST00000442986 3245 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRAMEF11-201ENST00000619922 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MT2P1-201ENST00000262499 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP19-201ENST00000365186 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP172-201ENST00000411341 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357055.2-201ENST00000412567 434 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245452.4-201ENST00000423821 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01779-201ENST00000426515 914 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357992.1-201ENST00000433442 130 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL669970.1-201ENST00000444936 450 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GFOD1-AS1-201ENST00000446001 332 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL360181.1-201ENST00000452591 184 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02051-201ENST00000456535 690 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090955.1-201ENST00000458338 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL231P-201ENST00000461840 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HLA-DPB2-206ENST00000470997 776 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL503P-201ENST00000475222 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL546P-201ENST00000479428 290 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008740.1-201ENST00000549658 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025031.2-201ENST00000550319 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 COX5AP2-201ENST00000554418 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02304-201ENST00000554445 445 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AP007216.1-201ENST00000563932 385 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010760.1-201ENST00000565129 545 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4442-201ENST00000583412 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms