Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PPRC1-202ENST00000370012 2163 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE2-205ENST00000594076 2193 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590666.3-201ENST00000441272 4122 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTR1A-205ENST00000487599 2726 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FLRT2-204ENST00000554746 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB6B-207ENST00000543906 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ADD3-203ENST00000360162 3114 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 C4orf46-201ENST00000379205 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINGO4-201ENST00000368820 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH11-203ENST00000452625 6886 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM90A3P-201ENST00000506444 1395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM90A4P-201ENST00000509856 1395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NFRKB-201ENST00000446488 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH5-204ENST00000420622 2711 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FUT6-202ENST00000318336 3137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RBFOX1-202ENST00000340209 4099 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms