Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms