Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD1BQ9P298 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD1BQ9P298 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms