Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms