Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms