Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDB2Q92466 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms