Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms