Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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