Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BSXQ3C1V8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms