Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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