Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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