Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GPS1Q13098 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GPS1Q13098 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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