Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC3A1Q07837 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms