Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FMODQ06828 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FMODQ06828 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms