Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL20P78556 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms