Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HBBP68871 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HBBP68871 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms