Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTG2P63267 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG2P63267 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms