Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA2P62736 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms