Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CASQ1P31415 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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