Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms