Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASTP20810 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASTP20810 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASTP20810 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASTP20810 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms