Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYN1P17600 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYN1P17600 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYN1P17600 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYN1P17600 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYN1P17600 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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