Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEACAM1P13688 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEACAM1P13688 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms