Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMUO75648 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRMUO75648 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRMUO75648 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRMUO75648 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRMUO75648 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRMUO75648 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms