Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP27XA6NNY8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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USP27XA6NNY8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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USP27XA6NNY8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP27XA6NNY8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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