Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD3L3A6NE82 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD3L3A6NE82 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms