Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37CA5D8V6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms