Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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