Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4Q9UBX2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms