Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNTG1Q9NSN8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms