Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XKR8Q9H6D3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XKR8Q9H6D3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms