Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms