Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D1Q8WV19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms