Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms