Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5H4

POTEB, POTE ankyrin domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEBQ6S5H4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEBQ6S5H4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEBQ6S5H4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms