Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN1Q6NZI2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms