Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC7AQ5VTJ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC7AQ5VTJ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms