Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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