Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 COPE-206ENST00000597026 678 ntTSL 219.91■□□□□ 0.783e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 516.74■□□□□ 0.273e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 516.2■□□□□ 0.183e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 PSMC5-218ENST00000584657 576 ntTSL 27.82□□□□□ -1.163e-10■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 SND1-206ENST00000468166 552 ntTSL 49.85□□□□□ -0.833e-9■□□□□ 11.3
G3BP1Q13283 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 222.56■■□□□ 1.26e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 KIF22-207ENST00000568312 781 ntTSL 314.73□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 514.27□□□□□ -0.132e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PRMT1-206ENST00000526224 578 ntTSL 312.34□□□□□ -0.432e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.867e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.687e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PABPC1-209ENST00000519100 851 ntTSL 33.21□□□□□ -1.91e-12■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PTBP1-217ENST00000592113 1548 ntTSL 527.92■■■□□ 2.062e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ATP7B-216ENST00000635406 506 ntTSL 425.94■■□□□ 1.742e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 324.63■■□□□ 1.532e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 COPS6-210ENST00000496358 610 ntTSL 222.75■■□□□ 1.232e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 COPS6-207ENST00000472107 835 ntTSL 222.19■■□□□ 1.142e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 COPS6-203ENST00000419210 218 ntTSL 321.91■■□□□ 1.12e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 COPS6-206ENST00000468499 745 ntTSL 321.69■■□□□ 1.062e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 COPS6-205ENST00000465027 1171 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.822e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ATP7B-208ENST00000482841 1845 ntTSL 219.9■□□□□ 0.782e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.762e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ALDH7A1-220ENST00000636190 1357 ntTSL 517.1■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 316.2■□□□□ 0.182e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PTBP1-213ENST00000587191 357 ntTSL 514.37□□□□□ -0.112e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PTBP1-205ENST00000585535 314 ntTSL 314.16□□□□□ -0.142e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 MACF1-215ENST00000473843 598 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.922e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 27.25□□□□□ -1.252e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 DLC1-216ENST00000521730 485 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 SMG8-205ENST00000580798 583 ntTSL 34.43□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.782e-10■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ARFGEF2-202ENST00000493140 245 ntTSL 22.33□□□□□ -2.042e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 SF3B3-212ENST00000568539 555 ntTSL 210.47□□□□□ -0.735e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.585e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.315e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PRKAR1A-208ENST00000585815 553 ntTSL 510.4□□□□□ -0.742e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 53.69□□□□□ -1.823e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 GALK1-209ENST00000592997 717 ntTSL 223.11■■□□□ 1.292e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-12■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 529.76■■■□□ 2.357e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 326.55■■□□□ 1.847e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 226.45■■□□□ 1.827e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 POLR2A-206ENST00000576553 602 ntTSL 225.79■■□□□ 1.723e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 525.62■■□□□ 1.697e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 222.13■■□□□ 1.137e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 322.13■■□□□ 1.137e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 518.31■□□□□ 0.527e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 512.7□□□□□ -0.387e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 516.22■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PEG10-207ENST00000613043 574 ntTSL 515.78■□□□□ 0.125e-56■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.124e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.044e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.024e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.644e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.554e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.314e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.234e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.224e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.184e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 321.49■■□□□ 1.034e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 221.49■■□□□ 1.034e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.034e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 521.25■□□□□ 0.994e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 520.93■□□□□ 0.944e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.944e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 219.73■□□□□ 0.754e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.684e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.434e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 516.81■□□□□ 0.284e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 212.75□□□□□ -0.374e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 VIL1-205ENST00000454069 532 ntTSL 312.71□□□□□ -0.373e-9■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 517.61■□□□□ 0.414e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HADHB-206ENST00000479347 670 ntTSL 210.71□□□□□ -0.693e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 TXNIP-203ENST00000488537 1509 ntTSL 58.72□□□□□ -1.015e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.355e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 ZC3H15-209ENST00000498757 881 ntTSL 28.24□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 DDX24-208ENST00000556635 656 ntTSL 221.03■□□□□ 0.966e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 DDX24-204ENST00000553451 486 ntTSL 35.88□□□□□ -1.476e-7■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 GTF3C1-205ENST00000564747 2798 nt18.53■□□□□ 0.562e-6■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PKM-223ENST00000569050 457 ntTSL 420.64■□□□□ 0.891e-21■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PRKAR1A-219ENST00000589480 549 ntTSL 212.32□□□□□ -0.442e-8■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.72e-11■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 26.18□□□□□ -1.422e-14■□□□□ 11.2
G3BP1Q13283 PABPC1-212ENST00000519622 667 ntTSL 55.38□□□□□ -1.551e-12■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 PABPC1-211ENST00000519596 771 ntTSL 32.96□□□□□ -1.941e-12■□□□□ 11.1
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 20.4 ms