Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNH2Q12809 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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