Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms